Στις 26 Απριλίου του 1903 Μαδριλένοι και Βάσκοι φοιτητές αποφασίζουν να δημιουργήσουν μια θυγατρική ομάδα της Αθλέτικ Μπιλμπάο στην πρωτεύουσα της Ισπανίας, όπου μάλιστα οι δύο ομάδες δεν μπορούσαν να τεθούν αντιμέτωπες. Τέσσερα χρόνια αργότερα το 1907 αποφασίστηκε η πλήρης ανεξαρτητοποίηση απο την Αθλέτικ, και απο τον Ιανουάριο του 1947 ο σύλλογος ονομάζεται Ατλέτικο αντί για Αθλέτικο.
Η πρώτη φορά που αναμετρήθηκαν οι δύο ομάδες ήταν στις 8 Μαΐου του 1921 στον τελικό του Κυπέλλου Ισπανίας με τους "ροχιμπλάνκος" του Μπιλμπάο να παίρνουν την νίκη και τον τίτλο με 4-1, με τους Λάκα στο 29' και στο 73' και Ασέδο στο 41' με πέναλντι και στο 68' να σκοράρουν για τους Βάσκους, ενώ για την Ατλέτικο είχε ισοφαρίσει προσωρινά ο Τριάνα στο 38'.
Την περίοδο 1940-1941 έδωσαν μάχη για τον τίτλο που κρίθηκε την τελευταία αγωνιστική. Οι δύο ομάδες ισοβαθμούσαν στην πρώτη θέση με 31 βαθμούς, οι Μαδριλένοι δεν αντιμετώπισαν προβλήματα απέναντι στην Οβιέδο επικρατώντας με 3-0 και σε συνδυασμό της ήττας της Αθλέτικ απο την Μπαρτσελόνα στην Βαρκελώνη, κατέκτησαν την πρώτη θέση.
Την περίοδο 1969-1970 τα πάντα κρίθηκαν τις τελευταίες αγωνιστικές. Στην 28η η Αθλέτικ επικράτησε στο Μπιλμπάο της Ατλέτικο με 2-0 χάρις στα γκολ των Ουριάρτε και Άντον Αριέτα και πήρε κεφάλι στον βαθμολογικό πίνακα με 39 έναντι 38.
Την αμέσως επόμενη αγωνιστική όμως την ήττα απο την Βαλένθια δεν την άφησε να πάει χαμένη και με την νίκη της επί της Ρεάλ Σοσιεδάδ πήρε εκ νέου το προβάδισμα με 40 έναντι 39. Τα πάντα θα κρίνονταν την τελευταία αγωνιστική με τους "ροχιμπλάνκος" να ταξιδεύουν στο Σαμπαντέλ και την Αθλέτικ να υποδέχεται την Θέλτα.
Ουφάρτε και Καγιέχα σκόραραν για την ομάδα του Μαρσέλ Ντομίνγκο με συνέπεια η Ατλέτικο να πανηγυρίσει το 6ο Πρωτάθλημα της ιστορίας της.
Την περίοδο 1969-1970 τα πάντα κρίθηκαν τις τελευταίες αγωνιστικές. Στην 28η η Αθλέτικ επικράτησε στο Μπιλμπάο της Ατλέτικο με 2-0 χάρις στα γκολ των Ουριάρτε και Άντον Αριέτα και πήρε κεφάλι στον βαθμολογικό πίνακα με 39 έναντι 38.
Την αμέσως επόμενη αγωνιστική όμως την ήττα απο την Βαλένθια δεν την άφησε να πάει χαμένη και με την νίκη της επί της Ρεάλ Σοσιεδάδ πήρε εκ νέου το προβάδισμα με 40 έναντι 39. Τα πάντα θα κρίνονταν την τελευταία αγωνιστική με τους "ροχιμπλάνκος" να ταξιδεύουν στο Σαμπαντέλ και την Αθλέτικ να υποδέχεται την Θέλτα.
Ουφάρτε και Καγιέχα σκόραραν για την ομάδα του Μαρσέλ Ντομίνγκο με συνέπεια η Ατλέτικο να πανηγυρίσει το 6ο Πρωτάθλημα της ιστορίας της.
Πέρα του τελικού του 1921, υπάρχουν δύο ακόμα τελικοί κυπέλλου. Ο πρώτος ήταν το 1956 στο "Σαντιάγκο Μπερναμπέου" με την Αθλέτικ να επικρατεί με 2-1 με ανατροπή αφού η Ατλέτικο προηγήθηκε με τον Μολίνα στο 26', αλλά οι Αρτέτσε στο 37' και Μαγκουρέγκoυι στο 70' έδωσαν την νίκη στην Αθλέτικ.
Ο δεύτερος ήταν το 1985 και πάλι στο "Σαντιάγκο Μπερναμπέου" με τους Μαδριλένους αυτή την φορά να επικρατούν με 2-1, χάρις σε δύο γκολ του Μεξικάνου Ούγκο Σάντσεζ στο 24' με πέναλντι και στο 55'.
Ο δεύτερος ήταν το 1985 και πάλι στο "Σαντιάγκο Μπερναμπέου" με τους Μαδριλένους αυτή την φορά να επικρατούν με 2-1, χάρις σε δύο γκολ του Μεξικάνου Ούγκο Σάντσεζ στο 24' με πέναλντι και στο 55'.
Για την για την Αθλέτικ είχε μειώσει ο Χούλιο Σαλίνας στο 75' η οποία είχε μείνει απο το 88' με παίκτη λιγότερο λόγω αποβολής του Λισεράνσου με απευθείας κόκκινη κάρτα.
Οι δύο ομάδες έχουν βρεθεί και σε τελικό ευρωπαϊκής διοργάνωσης την περίοδο 2011-2012 στο Europa League στο Βουκουρέστι με τους Μαδριλένους να κατακτούν το τρόπαιο με 3-0, με μεγάλο πρωταγωνιστή τον Κολομβιανό Ραδαμέλ Φαλκάο που πέτυχε δύο τέρματα στο 7' και στο 34', ενώ το τρίτο το πέτυχε ο Ντιέγκο στο 85'.
Συνολικά σε 214 παιχνίδια η Ατλέτικο έχει 94 νίκες, 84 η Αθλέτικ, 36 ματς έχουν λήξει ισόπαλα, με τα τέρματα να είναι 333-329 υπέρ της Ατλέτικο. Οι μεγαλύτερες νίκες της Ατλέτικο είναι το 5-0 την περίοδο 1940-1941, και το 4-0 τις περιόδους 1946-1947, 1964-1965, 1978-1979 και 2012-2013,ενώ της Μπιλμπάο είναι το 6-0 την περίοδο 1941-1942 και το 5-2 την περίοδο 1953-1954.
Πρώτος σκόρερ είναι ο Τέλμο Θάρα της Αθλέτικ με 18, στην δεύτερη θέση βρίσκεται ο Αγκουστίν Γκαίνθα της Αθλέτικ με 10 και ακολουθούν οι Ραφαέλ Ιριόντο(Αθλέτικ) και Βενάνσιο Πέρεζ(Αθλέτικ) με 9, Χοσέ Πανίσο(Αθλέτικ), Αντόν Αριέτα(Αθλέτικ), Αντριάν Εσκουδέρο(Ατλέτικο), Λουίς Αραγονιές(Ατλέτικο), Φρανσίσκο Γκαράτε(Αθλέτικ), Ντάνι(Αθλέτικ) και Φερνάντο Τόρες(Ατλέτικο) με 8, Χοσέ Χουνκόσα(Ατλέτικο), Χοσέ Εουλόχιο Γκαράτε(Ατλέτικο), Ενέκο Αριέτα(Αθλέτικ), Τσέτσου Ρόχο(Ατλέτικο), Μανόλο(Ατλέτικο), Ντιέγκο Φορλάν(Ουρουγουάη/Ατλέτικο), Ραδαμέλ Φαλκάο(Κολομβία/Ατλέτικο) και Αντουάν Γκριεζμάν(Γαλλία/Ατλέτικο) με 7 τέρματα.
Πρώτος σε συμμετοχές είναι ο Χοσέ Ιριμπάρ(Αθλέτικ) με 40, στην δεύτερη θέση βρίσκεται ο Αγκουστίν Γκαίνθα(Αθλέτικ) με 37, και ακολουθούν οι Χοσέ Μαρία Ορούε(Αθλέτικ) και Αντελάρδο(Αθλέτικ) με 35, Τσέτσου Ρόχο(Αθλέτικ) με 32, Κανίτο(Αθλέτικ) με 31, Χοσέ Πανίσο(Αθλέτικ), Κόκε(Ατλέτικο) και Ραούλ Γκαρσία(Ατλέτικο 12/Αθλέτικ 17) με 29, Χαβιέ Ιρουρέτα(Ατλέτικο 18/Αθλέτικ 10) με 28, Ισάκιο Καγιέχα(Ατλέτικο), Όσκαρ Ντε Μάρκος(Αθλέτικ) και Ίκερ Μουνιαίν(Αθλέτικ) με 27, Τέλμο Θάρα(Αθλέτικ), Ενρίκε Κογιάρ(Ατλέτικο) Φιντέλ Ουριάρτε(Αθλέτικ), με 26, Ραφαέλ Ιριόντο(Αθλέτικ), Mαρκέλ Σουσαέτα(Αθλέτικ) με 25, Άντον Αριέτα(Αθλέτικ), Λουίς Αραγονιές(Ατλέτικο), Άντονι Ιραόλα(Αθλέτικ) με 24, Χοσέ Λουίς Αρτέτσε(Αθλέτικ), Λουίς Μαρία Ετσεμπερία(Αθλέτικ), Ινιάκι Σάεθ(Αθλέτικ), Καρμέλο Σεντρούν(Αθλέτικ) με 23.
Χερμενεγκίλδο Γκαρσία, Zουλιάν Ρουέτε, Φρανσίσκο Μπελαούστε, Μανουέλ Βιδάλ Ερμόσα, Λουίς Μπεκιριστάιν, Μαρσελίνο Γκάλατας, Μανουέλ Σουάρες Ντε Μπεγκόνια, Ραμόν Ντε Λα Φουέντε, Χαβιέ Ιρουρέτα, Πάτσι Φερέιρα, Χοσέ Αντόνιο Γκόμες, Άντονι Γκοικοετσέα, Χούλιο Σαλίνας, Πέδρο Ουράλδε, Σαντιάγκο Εθκέρο, Ντανιέλ Αρανθούμπια, Ραούλ Γκαρσία είναι οι παίκτες που έχουν αγωνιστεί και στις δύο ομάδες.
Φρέντ Πέντλαντ(Αγγλία), Γουόλτερ Χάρις(Αγγλία), Αντόνιο Μπάριος, Φέρντιναντ Ντάουτσικ(Σλοβακία),, Χαβιέ Κλεμέντε είναι οι προπονητές που έχουν κάτσει στους πάγκους των δύο ομάδων.
O Μανουέλ Ανατόλ αγωνίστηκε στην Αθλέτικ απο το 1926 έως το 1928 και απο το 1932 έως το 1933 στην Ατλέτικο και το 1933 ανέλαβε την τεχνική της ηγεσία. Ο Χοσέ Μαρία Μαγκουρεγκουί αγωνίστηκε στους Βάσκους απο το 1952 έως το 1961 και το 1988 ανέλαβε την τεχνική ηγεσία της Ατλέτικο.